Protein–RNA interactions for Protein: O94911

ABCA8, ATP-binding cassette sub-family A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA8O94911 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCA8O94911 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCA8O94911 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCA8O94911 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCA8O94911 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms