Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOO75962 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIOO75962 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIOO75962 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOO75962 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOO75962 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOO75962 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOO75962 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOO75962 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOO75962 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOO75962 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOO75962 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOO75962 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOO75962 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOO75962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOO75962 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOO75962 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOO75962 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOO75962 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOO75962 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOO75962 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIOO75962 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIOO75962 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOO75962 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOO75962 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms