Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFPL2O75678 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFPL2O75678 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFPL2O75678 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL2O75678 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms