Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPLO60437 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PPLO60437 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PPLO60437 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PPLO60437 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PPLO60437 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PPLO60437 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PPLO60437 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PPLO60437 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PPLO60437 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPLO60437 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPLO60437 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPLO60437 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPLO60437 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPLO60437 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPLO60437 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPLO60437 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPLO60437 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPLO60437 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPLO60437 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPLO60437 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPLO60437 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPLO60437 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPLO60437 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPLO60437 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPLO60437 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPLO60437 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPLO60437 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPLO60437 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPLO60437 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPLO60437 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPLO60437 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPLO60437 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PPLO60437 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPLO60437 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPLO60437 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PPLO60437 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPLO60437 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPLO60437 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPLO60437 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPLO60437 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPLO60437 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPLO60437 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPLO60437 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPLO60437 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPLO60437 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PPLO60437 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PPLO60437 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms