Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP10AO60312 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ATP10AO60312 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP10AO60312 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP10AO60312 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms