Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCO2O43819 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCO2O43819 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCO2O43819 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCO2O43819 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCO2O43819 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCO2O43819 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCO2O43819 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCO2O43819 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCO2O43819 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms