Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX6O43752 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX6O43752 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX6O43752 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX6O43752 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STX6O43752 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STX6O43752 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STX6O43752 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STX6O43752 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX6O43752 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STX6O43752 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX6O43752 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STX6O43752 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
STX6O43752 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX6O43752 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX6O43752 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX6O43752 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STX6O43752 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX6O43752 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX6O43752 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX6O43752 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX6O43752 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX6O43752 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX6O43752 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX6O43752 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX6O43752 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX6O43752 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX6O43752 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX6O43752 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STX6O43752 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX6O43752 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX6O43752 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX6O43752 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX6O43752 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX6O43752 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX6O43752 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX6O43752 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX6O43752 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX6O43752 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX6O43752 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX6O43752 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX6O43752 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX6O43752 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX6O43752 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX6O43752 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX6O43752 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms