Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTRA2O43464 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms