Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC27A2O14975 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC27A2O14975 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms