Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC188H7C350 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC188H7C350 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC188H7C350 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms