Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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