Protein–RNA interactions for Protein: F8VZ95

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VZ95 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F8VZ95 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
F8VZ95 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
F8VZ95 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F8VZ95 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F8VZ95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F8VZ95 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F8VZ95 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F8VZ95 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F8VZ95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VZ95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VZ95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VZ95 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F8VZ95 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VZ95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F8VZ95 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F8VZ95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F8VZ95 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VZ95 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VZ95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VZ95 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F8VZ95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VZ95 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VZ95 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VZ95 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VZ95 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F8VZ95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F8VZ95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms