Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBY3A6NI87 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBY3A6NI87 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms