Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF25A6NGN4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF25A6NGN4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms