Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC160A6NGH7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms