Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L9A6NEM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms