Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCCD1A6NED2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCCD1A6NED2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCCD1A6NED2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RCCD1A6NED2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms