Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf170A2RU37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms