Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA3Q9Y6Q9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCOA3Q9Y6Q9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCOA3Q9Y6Q9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.6 ms