Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB6Q9Y5E3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms