Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRP12Q9Y561 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LRP12Q9Y561 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRP12Q9Y561 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms