Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF12Q9Y4X4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF12Q9Y4X4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF12Q9Y4X4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms