Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXND1Q9Y4D7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLXND1Q9Y4D7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLXND1Q9Y4D7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms