Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD4AQ9UPU9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD4AQ9UPU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms