Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HDAC9Q9UKV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC9Q9UKV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms