Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERG28Q9UKR5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms