Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD3Q9UJU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXD3Q9UJU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXD3Q9UJU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms