Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms