Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPG2Q9UBF2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG2Q9UBF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG2Q9UBF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms