Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHD7Q9P2D1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHD7Q9P2D1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHD7Q9P2D1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms