Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKIRAS2Q9NYR9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NKIRAS2Q9NYR9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms