Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTN4Q9NQC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTN4Q9NQC3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms