Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCX3BQ9H321 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3BQ9H321 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCX3BQ9H321 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 512.7 ms