Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GINS3Q9BRX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GINS3Q9BRX5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms