Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN2Q99700 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN2Q99700 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN2Q99700 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN2Q99700 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms