Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCNAQ96QF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCNAQ96QF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCNAQ96QF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms