Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CR12Q96Q35 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2CR12Q96Q35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms