Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC2Q96PR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNC2Q96PR1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC2Q96PR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms