Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SORCS2Q96PQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SORCS2Q96PQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms