Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF558Q96NG5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF558Q96NG5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF558Q96NG5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms