Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CABS1Q96KC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABS1Q96KC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms