Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM10Q96HG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10Q96HG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM10Q96HG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms