Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGAP3Q96FM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PGAP3Q96FM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGAP3Q96FM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms