Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VWCEQ96DN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VWCEQ96DN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWCEQ96DN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms