Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SH3KBP1Q96B97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3KBP1Q96B97 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3KBP1Q96B97 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms