Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKD1Q969G9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD1Q969G9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD1Q969G9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms