Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC2Q92769 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC2Q92769 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC2Q92769 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms