Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKAP2Q8WWK9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP2Q8WWK9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms