Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM239Q8WW34 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM239Q8WW34 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM239Q8WW34 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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