Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJA4Q8WW22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJA4Q8WW22 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJA4Q8WW22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJA4Q8WW22 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms